組織サーベイのアンケート内のコメントはダウンロードできる？

はい、できます。

CSV形式ですべてのコメントをダウンロード可能です。 ［左上メニュー］>［組織サーベイ］>［回答結果の出力］から、アンケート結果とあわせてダウンロードできます。